Lisaks HVFI põhikirjale reguleerivad instituudi nõukogu ja kraadinõukogu tegevust järgmised dokumendid:
Tartu Ülikooli põhikiri
TÜ doktorikraadi andmise kord
HVFI nõukogu kodukord
HVFI doktoritööde kaitsmise kodukord
HVFI nõukogu juhend doktoritöö eelretsensendile
FLFI nõukogu juhend doktoritöö oponendile
Filosoofia ja semiootika instituudi nõukogu (alates 17.01.2023)
- Bruno Mölder, professor, HVFI juhataja — nõukogu esimees
- Ruth Jürjo, HVFI koordinaator, nõukogu sekretär
- Kalevi Kull, professor
- Timo Maran, professor
- Pärtel Piirimäe, professor
- Margit Sutrop, professor
- Peeter Torop, professor
- Piret Kuusk, TÜ füüsika instituudi kaasprofessor
- Daniele Monticelli, TLÜ professor
- Alexander Stewart Davies, kaasprofessor, filosoofia doktoriõppe eriala esindaja
- Tiit Remm, teadur, semiootika ja kultuuriteooria programmijuht
- Uku Tooming, teadur, filosoofia programmijuht
- Jaana Eigi-Watkin, teadur
- Nelly Mäekivi, teadur
- Maarja Ojamaa, kaasprofessor
- Francesco Orsi, kaasprofessor
- Triin Paaver, administratiivjuht
- Kadri Simm, kaasprofessor
- Ulvi Urm, vastutav sekretär
- Andreas Ventsel, kaasprofessor
- Maarja Kroon, üliõpilasesindaja (semiootika bakalaureuseõpe)
- Sven Anderson, üliõpilasesindaja (semiootika doktoriõpe)
- Auli Viidalepp, üliõpilasesindaja (semiootika doktoriõpe)
- Ana Maric, üliõpilasesindaja (semiootika bakalaureuseõpe)
- Karl Lembit Laane, üliõpilasesindaja (filosoofia magistriõpe)
- Jay Allen Zameska, üliõpilasesindaja (filosoofia doktoriõpe)